Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ARCN1P48444 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ARCN1P48444 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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ARCN1P48444 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARCN1P48444 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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