Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms