Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDIT3P35638 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDIT3P35638 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDIT3P35638 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDIT3P35638 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDIT3P35638 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDIT3P35638 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDIT3P35638 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDIT3P35638 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDIT3P35638 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDIT3P35638 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDIT3P35638 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDIT3P35638 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDIT3P35638 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDIT3P35638 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDIT3P35638 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 SEC24B-202ENST00000399100 3780 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DDIT3P35638 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms