Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPB2P35606 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COPB2P35606 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COPB2P35606 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPB2P35606 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COPB2P35606 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COPB2P35606 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPB2P35606 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPB2P35606 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPB2P35606 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPB2P35606 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COPB2P35606 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COPB2P35606 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPB2P35606 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPB2P35606 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPB2P35606 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPB2P35606 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPB2P35606 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPB2P35606 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPB2P35606 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPB2P35606 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPB2P35606 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPB2P35606 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPB2P35606 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COPB2P35606 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPB2P35606 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPB2P35606 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPB2P35606 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COPB2P35606 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPB2P35606 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPB2P35606 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPB2P35606 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPB2P35606 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPB2P35606 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPB2P35606 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPB2P35606 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPB2P35606 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms