Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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HOXC13P31276 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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HOXC13P31276 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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HOXC13P31276 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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HOXC13P31276 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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