Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRHP20396 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRHP20396 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRHP20396 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRHP20396 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRHP20396 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRHP20396 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRHP20396 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRHP20396 KCNMA1-AS1-201ENST00000426234 863 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRHP20396 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRHP20396 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRHP20396 QTRT2-209ENST00000479882 1196 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRHP20396 AC253536.5-201ENST00000506097 347 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRHP20396 AC011389.2-201ENST00000514811 365 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRHP20396 AL355075.5-201ENST00000553568 890 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRHP20396 RAB42P1-201ENST00000555078 316 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRHP20396 ZNF223-202ENST00000585552 541 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRHP20396 AC245884.8-201ENST00000599382 880 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRHP20396 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRHP20396 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRHP20396 AC006511.4-201ENST00000631571 561 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRHP20396 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRHP20396 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRHP20396 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRHP20396 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRHP20396 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRHP20396 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRHP20396 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRHP20396 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRHP20396 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRHP20396 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRHP20396 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRHP20396 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRHP20396 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRHP20396 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRHP20396 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRHP20396 CDA-201ENST00000375071 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRHP20396 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRHP20396 RPP30-203ENST00000413330 1004 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRHP20396 LINC00271-202ENST00000436554 655 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRHP20396 RPSAP16-201ENST00000447583 821 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRHP20396 AC010997.1-201ENST00000447646 350 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRHP20396 RN7SL22P-201ENST00000471800 269 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRHP20396 KRTAP2-2-202ENST00000542910 390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRHP20396 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRHP20396 HNRNPA1P11-201ENST00000580106 956 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRHP20396 AC015802.4-203ENST00000592622 570 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRHP20396 Metazoa_SRP.152-201ENST00000614413 286 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRHP20396 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRHP20396 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRHP20396 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRHP20396 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRHP20396 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRHP20396 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRHP20396 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRHP20396 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRHP20396 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRHP20396 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRHP20396 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRHP20396 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRHP20396 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRHP20396 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRHP20396 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRHP20396 RHCE-203ENST00000346452 971 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRHP20396 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRHP20396 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRHP20396 AC004884.1-201ENST00000393647 319 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRHP20396 AL512444.1-201ENST00000419644 480 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRHP20396 AC010163.1-201ENST00000434440 520 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRHP20396 RPL13AP5-201ENST00000439189 612 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRHP20396 AL356019.1-201ENST00000553419 748 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRHP20396 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRHP20396 AC021439.1-201ENST00000562975 591 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRHP20396 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRHP20396 C5orf60-208ENST00000625191 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRHP20396 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRHP20396 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRHP20396 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRHP20396 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRHP20396 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRHP20396 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRHP20396 SIGLEC17P-204ENST00000618545 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRHP20396 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRHP20396 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRHP20396 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRHP20396 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRHP20396 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRHP20396 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRHP20396 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRHP20396 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRHP20396 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRHP20396 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRHP20396 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRHP20396 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRHP20396 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRHP20396 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRHP20396 LYG2-201ENST00000333017 862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRHP20396 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRHP20396 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRHP20396 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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