Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms