Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VTNP04004 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VTNP04004 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VTNP04004 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VTNP04004 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VTNP04004 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VTNP04004 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VTNP04004 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VTNP04004 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VTNP04004 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VTNP04004 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VTNP04004 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VTNP04004 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VTNP04004 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VTNP04004 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VTNP04004 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VTNP04004 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VTNP04004 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VTNP04004 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VTNP04004 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VTNP04004 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VTNP04004 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VTNP04004 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VTNP04004 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VTNP04004 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VTNP04004 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VTNP04004 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VTNP04004 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VTNP04004 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VTNP04004 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VTNP04004 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VTNP04004 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VTNP04004 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VTNP04004 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VTNP04004 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VTNP04004 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VTNP04004 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VTNP04004 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VTNP04004 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VTNP04004 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VTNP04004 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VTNP04004 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VTNP04004 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VTNP04004 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VTNP04004 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VTNP04004 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VTNP04004 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VTNP04004 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VTNP04004 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms