Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 PHBP3-201ENST00000412562 819 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 AC007690.1-201ENST00000451924 468 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 PARVG-208ENST00000466375 820 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 HNRNPA1P7-201ENST00000521273 963 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 SLC25A3-212ENST00000549338 1285 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 SOX2-OT-228ENST00000597828 864 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 ZNF677-207ENST00000598806 701 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 CD74-201ENST00000009530 981 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 TRIQK-219ENST00000523580 1630 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 FAHD2A-204ENST00000447036 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 RANGRF-201ENST00000226105 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 MRPS16P3-201ENST00000415961 374 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 AC008267.3-201ENST00000448776 712 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 CST7-201ENST00000480798 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 RAB42P1-201ENST00000555078 316 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 AL590491.2-202ENST00000611126 418 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 MED25-209ENST00000612791 881 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 SLC50A1-214ENST00000622581 1245 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 PDZD9-201ENST00000424898 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 AL512422.2-201ENST00000426453 551 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 AC105443.1-201ENST00000433754 712 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 AC078878.2-201ENST00000543451 286 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 ARL17B-207ENST00000575960 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 HNRNPA1P11-201ENST00000580106 956 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 AC112702.1-201ENST00000623712 366 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ABCC9O60706 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 MKNK1-205ENST00000428112 1270 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 TMEM241-208ENST00000542162 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 AC099524.1-203ENST00000565272 756 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 LINC02130-201ENST00000566054 518 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 KIR2DL4-203ENST00000357494 1396 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 FAM157C-201ENST00000563357 1806 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 FPGT-205ENST00000482102 561 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 RN7SL452P-201ENST00000482923 291 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 FTH1-205ENST00000529631 507 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 AC004923.4-201ENST00000532296 739 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 MRPL51-205ENST00000543164 814 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 MRPL51-206ENST00000543703 441 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms