Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SOBPA7XYQ1 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SOBPA7XYQ1 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SOBPA7XYQ1 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SOBPA7XYQ1 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SOBPA7XYQ1 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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SOBPA7XYQ1 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SOBPA7XYQ1 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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