Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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