Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms