Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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