Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CATSPER4Q7RTX7 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms