Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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USP43Q70EL4 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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USP43Q70EL4 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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USP43Q70EL4 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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USP43Q70EL4 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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USP43Q70EL4 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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USP43Q70EL4 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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USP43Q70EL4 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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USP43Q70EL4 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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USP43Q70EL4 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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USP43Q70EL4 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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