Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB3L3Q68CJ9 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms