Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
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