Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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RTL8BQ17RB0 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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RTL8BQ17RB0 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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RTL8BQ17RB0 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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RTL8BQ17RB0 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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RTL8BQ17RB0 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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RTL8BQ17RB0 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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