Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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RTN1Q16799 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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RTN1Q16799 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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RTN1Q16799 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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RTN1Q16799 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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