Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM53BQ14153 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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