Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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