Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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