Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms