Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 AC004834.1-202ENST00000638785 1737 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 TRIM21-201ENST00000254436 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 EXOC7-207ENST00000411744 2031 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 LINC00523-206ENST00000556697 2071 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 ABLIM3-203ENST00000356541 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 ABLIM3-211ENST00000517451 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 CACNB3-204ENST00000547230 2395 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 AC009108.4-201ENST00000623284 2451 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 TMEM86A-201ENST00000280734 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 GGTA1P-205ENST00000495328 3478 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 ZNF287-202ENST00000395825 3208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 AC009533.1-201ENST00000539757 3158 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 MRVI1-209ENST00000531107 2887 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 TGFBI-201ENST00000442011 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 LITAF-221ENST00000622633 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 CICP2-201ENST00000420675 2328 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 NBPF17P-201ENST00000401087 2119 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 CYP4F12-215ENST00000550308 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 NUSAP1-208ENST00000559596 1629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 CACNB1-212ENST00000622445 3722 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 APEH-201ENST00000296456 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 LDLR-207ENST00000558013 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 C1R-209ENST00000542285 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 MRPS16-202ENST00000372945 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 ANGEL2-208ENST00000535388 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 PLA2G4E-AS1-201ENST00000499478 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 KCNH1-205ENST00000638498 3479 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 HPSE2-201ENST00000370546 1849 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 POFUT2-203ENST00000349485 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 DYNC1I1-204ENST00000437599 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 TXLNG-202ENST00000398155 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 COG4-202ENST00000393612 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 CPA5-208ENST00000485477 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 ACADL-201ENST00000233710 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 DCAF6-203ENST00000367843 3302 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
IFITM3Q01628 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms