Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 MPP2-221ENST00000625880 4668 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 DHODH-205ENST00000572887 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 FAM131A-211ENST00000639617 4450 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AP1G1-218ENST00000569748 4554 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 OTOG-203ENST00000399397 9948 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 ARPC5-202ENST00000359856 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 APC2-203ENST00000535453 11656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 NLRP1-208ENST00000571451 5444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 PAPLN-208ENST00000555445 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 CEP41-201ENST00000223208 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 MEGF8-203ENST00000378073 11034 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 TNRC6C-202ENST00000335749 9740 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 SLC12A6-205ENST00000458406 4425 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms