Protein–RNA interactions for Protein: P55286

CDH8, Cadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH8P55286 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH8P55286 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH8P55286 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH8P55286 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH8P55286 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH8P55286 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH8P55286 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH8P55286 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH8P55286 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH8P55286 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH8P55286 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH8P55286 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH8P55286 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH8P55286 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH8P55286 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH8P55286 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH8P55286 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH8P55286 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH8P55286 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH8P55286 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH8P55286 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH8P55286 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH8P55286 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH8P55286 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH8P55286 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH8P55286 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH8P55286 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH8P55286 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH8P55286 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH8P55286 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH8P55286 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH8P55286 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH8P55286 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH8P55286 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH8P55286 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH8P55286 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH8P55286 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH8P55286 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH8P55286 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH8P55286 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH8P55286 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH8P55286 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH8P55286 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH8P55286 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH8P55286 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH8P55286 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH8P55286 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH8P55286 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH8P55286 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH8P55286 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH8P55286 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH8P55286 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH8P55286 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH8P55286 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH8P55286 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH8P55286 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH8P55286 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH8P55286 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH8P55286 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH8P55286 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH8P55286 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH8P55286 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH8P55286 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH8P55286 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH8P55286 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH8P55286 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH8P55286 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH8P55286 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH8P55286 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH8P55286 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH8P55286 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH8P55286 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH8P55286 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH8P55286 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH8P55286 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH8P55286 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH8P55286 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH8P55286 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH8P55286 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH8P55286 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH8P55286 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH8P55286 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH8P55286 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH8P55286 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH8P55286 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH8P55286 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH8P55286 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH8P55286 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH8P55286 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH8P55286 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH8P55286 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH8P55286 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH8P55286 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH8P55286 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH8P55286 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH8P55286 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH8P55286 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH8P55286 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH8P55286 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH8P55286 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms