Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E1P51965 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms