Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPD2P43304 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPD2P43304 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPD2P43304 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPD2P43304 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPD2P43304 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPD2P43304 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPD2P43304 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GPD2P43304 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPD2P43304 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPD2P43304 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPD2P43304 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPD2P43304 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPD2P43304 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPD2P43304 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPD2P43304 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPD2P43304 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPD2P43304 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPD2P43304 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPD2P43304 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GPD2P43304 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPD2P43304 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPD2P43304 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GPD2P43304 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPD2P43304 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPD2P43304 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPD2P43304 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPD2P43304 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPD2P43304 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPD2P43304 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPD2P43304 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPD2P43304 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPD2P43304 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPD2P43304 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPD2P43304 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPD2P43304 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPD2P43304 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GPD2P43304 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPD2P43304 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPD2P43304 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPD2P43304 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPD2P43304 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPD2P43304 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPD2P43304 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPD2P43304 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GPD2P43304 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPD2P43304 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPD2P43304 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPD2P43304 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPD2P43304 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPD2P43304 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPD2P43304 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPD2P43304 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms