Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARID4AP29374 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms