Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHP20396 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRHP20396 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRHP20396 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRHP20396 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRHP20396 NDRG1-222ENST00000522476 1385 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRHP20396 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRHP20396 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRHP20396 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRHP20396 OR6N1-201ENST00000335094 1027 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRHP20396 SUSD3-201ENST00000375469 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRHP20396 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRHP20396 PIGL-202ENST00000395844 1257 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRHP20396 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRHP20396 AC131097.4-201ENST00000442867 571 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRHP20396 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRHP20396 AC067942.2-201ENST00000506227 1268 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRHP20396 AC092284.1-201ENST00000511386 1289 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRHP20396 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRHP20396 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRHP20396 SMIM6-202ENST00000579469 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRHP20396 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRHP20396 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRHP20396 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRHP20396 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRHP20396 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRHP20396 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRHP20396 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRHP20396 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRHP20396 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRHP20396 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRHP20396 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRHP20396 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
TRHP20396 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRHP20396 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRHP20396 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRHP20396 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRHP20396 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRHP20396 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRHP20396 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRHP20396 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRHP20396 REC114-201ENST00000331090 927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRHP20396 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRHP20396 MED27-202ENST00000357028 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRHP20396 FANK1-203ENST00000368693 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRHP20396 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRHP20396 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRHP20396 MESTP4-201ENST00000412333 1204 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRHP20396 HNRNPA1P68-201ENST00000425806 979 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRHP20396 PRDX3P2-201ENST00000447051 611 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRHP20396 SNORA74.2-201ENST00000516496 180 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRHP20396 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRHP20396 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRHP20396 AC025219.1-201ENST00000559299 526 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRHP20396 Z69706.1-201ENST00000595428 547 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRHP20396 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRHP20396 AC136475.1-203ENST00000602756 1034 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRHP20396 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRHP20396 AC013472.3-201ENST00000607407 659 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRHP20396 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRHP20396 FURIN-208ENST00000640725 224 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRHP20396 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRHP20396 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRHP20396 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRHP20396 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRHP20396 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRHP20396 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRHP20396 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRHP20396 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRHP20396 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRHP20396 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRHP20396 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRHP20396 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRHP20396 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRHP20396 SLC25A19-204ENST00000416858 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRHP20396 POLR2J2-203ENST00000476151 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRHP20396 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRHP20396 APOC2-201ENST00000252490 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRHP20396 KRTAP12-1-201ENST00000391617 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRHP20396 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRHP20396 AC006987.4-201ENST00000430032 279 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRHP20396 AC118758.1-201ENST00000448242 564 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRHP20396 AC022217.2-201ENST00000518941 472 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRHP20396 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRHP20396 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRHP20396 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRHP20396 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRHP20396 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRHP20396 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRHP20396 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRHP20396 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRHP20396 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRHP20396 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRHP20396 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRHP20396 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRHP20396 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRHP20396 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRHP20396 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRHP20396 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRHP20396 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms