Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VAV1P15498 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAV1P15498 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAV1P15498 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAV1P15498 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VAV1P15498 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAV1P15498 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VAV1P15498 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAV1P15498 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAV1P15498 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAV1P15498 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAV1P15498 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
VAV1P15498 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAV1P15498 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VAV1P15498 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAV1P15498 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAV1P15498 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAV1P15498 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAV1P15498 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VAV1P15498 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VAV1P15498 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VAV1P15498 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VAV1P15498 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VAV1P15498 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
VAV1P15498 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAV1P15498 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VAV1P15498 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VAV1P15498 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAV1P15498 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VAV1P15498 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VAV1P15498 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VAV1P15498 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VAV1P15498 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VAV1P15498 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAV1P15498 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VAV1P15498 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAV1P15498 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAV1P15498 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAV1P15498 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAV1P15498 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VAV1P15498 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VAV1P15498 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAV1P15498 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VAV1P15498 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAV1P15498 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VAV1P15498 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms