Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

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Length 766 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BRAFP15056 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BRAFP15056 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BRAFP15056 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BRAFP15056 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BRAFP15056 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BRAFP15056 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BRAFP15056 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BRAFP15056 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BRAFP15056 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BRAFP15056 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BRAFP15056 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BRAFP15056 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BRAFP15056 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BRAFP15056 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BRAFP15056 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BRAFP15056 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BRAFP15056 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
BRAFP15056 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
BRAFP15056 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BRAFP15056 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
BRAFP15056 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BRAFP15056 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
BRAFP15056 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BRAFP15056 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BRAFP15056 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BRAFP15056 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BRAFP15056 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BRAFP15056 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BRAFP15056 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BRAFP15056 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
BRAFP15056 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BRAFP15056 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BRAFP15056 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BRAFP15056 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BRAFP15056 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
BRAFP15056 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BRAFP15056 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BRAFP15056 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BRAFP15056 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BRAFP15056 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BRAFP15056 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BRAFP15056 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BRAFP15056 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BRAFP15056 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BRAFP15056 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BRAFP15056 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BRAFP15056 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BRAFP15056 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BRAFP15056 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BRAFP15056 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
BRAFP15056 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BRAFP15056 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BRAFP15056 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BRAFP15056 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BRAFP15056 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BRAFP15056 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BRAFP15056 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
BRAFP15056 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BRAFP15056 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BRAFP15056 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BRAFP15056 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BRAFP15056 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BRAFP15056 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BRAFP15056 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
BRAFP15056 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BRAFP15056 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BRAFP15056 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
BRAFP15056 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BRAFP15056 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BRAFP15056 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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BRAFP15056 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
BRAFP15056 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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BRAFP15056 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BRAFP15056 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BRAFP15056 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
BRAFP15056 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BRAFP15056 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BRAFP15056 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BRAFP15056 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BRAFP15056 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BRAFP15056 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BRAFP15056 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BRAFP15056 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BRAFP15056 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
BRAFP15056 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BRAFP15056 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BRAFP15056 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BRAFP15056 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BRAFP15056 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
BRAFP15056 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BRAFP15056 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BRAFP15056 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BRAFP15056 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BRAFP15056 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BRAFP15056 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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