Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms