Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MSI1O43347 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MSI1O43347 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MSI1O43347 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MSI1O43347 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MSI1O43347 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MSI1O43347 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MSI1O43347 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MSI1O43347 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MSI1O43347 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MSI1O43347 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MSI1O43347 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MSI1O43347 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MSI1O43347 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MSI1O43347 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MSI1O43347 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MSI1O43347 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MSI1O43347 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MSI1O43347 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MSI1O43347 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MSI1O43347 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MSI1O43347 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MSI1O43347 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MSI1O43347 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MSI1O43347 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MSI1O43347 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MSI1O43347 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MSI1O43347 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MSI1O43347 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MSI1O43347 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MSI1O43347 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MSI1O43347 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MSI1O43347 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MSI1O43347 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MSI1O43347 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MSI1O43347 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MSI1O43347 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MSI1O43347 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MSI1O43347 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MSI1O43347 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MSI1O43347 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MSI1O43347 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MSI1O43347 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MSI1O43347 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MSI1O43347 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MSI1O43347 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
MSI1O43347 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MSI1O43347 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MSI1O43347 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MSI1O43347 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MSI1O43347 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MSI1O43347 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MSI1O43347 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MSI1O43347 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MSI1O43347 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MSI1O43347 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MSI1O43347 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MSI1O43347 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MSI1O43347 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MSI1O43347 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MSI1O43347 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MSI1O43347 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MSI1O43347 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MSI1O43347 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MSI1O43347 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MSI1O43347 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MSI1O43347 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MSI1O43347 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MSI1O43347 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSI1O43347 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSI1O43347 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MSI1O43347 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSI1O43347 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSI1O43347 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSI1O43347 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSI1O43347 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSI1O43347 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSI1O43347 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSI1O43347 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSI1O43347 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSI1O43347 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSI1O43347 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSI1O43347 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSI1O43347 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSI1O43347 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSI1O43347 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSI1O43347 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSI1O43347 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSI1O43347 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSI1O43347 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSI1O43347 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSI1O43347 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSI1O43347 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSI1O43347 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MSI1O43347 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSI1O43347 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSI1O43347 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MSI1O43347 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSI1O43347 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSI1O43347 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms