Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms