Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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ZNF879B4DU55 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF879B4DU55 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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