Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms