Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms