Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP11Q9Y3A2 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms