Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X8

UBE2D4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D4, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D4Q9Y2X8 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
UBE2D4Q9Y2X8 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms