Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRP2BPQ9P2M1 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms