Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 SUCLG2-204ENST00000493112 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 RNA5SP84-201ENST00000364740 107 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 MRPL55-210ENST00000366736 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 LY6G6F-201ENST00000375832 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 RNA5SP407-201ENST00000410275 110 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 RN7SL148P-201ENST00000467120 279 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 AL662899.2-201ENST00000503322 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 AC022634.2-201ENST00000521504 382 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 AC104759.1-201ENST00000559109 939 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 SNHG21-205ENST00000561107 790 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 ARL17B-207ENST00000575960 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 AL139424.2-202ENST00000641335 1369 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 OR10K2-201ENST00000314902 939 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 MGST3-204ENST00000367888 778 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 NAA10-205ENST00000393712 908 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 GAPDHP65-201ENST00000425487 1006 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 FHIT-205ENST00000476844 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 AC003688.2-201ENST00000576271 415 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 SMIM22-206ENST00000589327 629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 AC007274.3-201ENST00000619838 385 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 CDK7-201ENST00000256443 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 AADACL4-201ENST00000376221 1575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 MIR1249-201ENST00000408671 66 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 PDZD9-201ENST00000424898 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 674 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 SPATA24-204ENST00000507779 606 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 AC004923.4-201ENST00000532296 739 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 AC116552.1-201ENST00000563243 733 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 AC009132.1-201ENST00000565194 320 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 EIF5A-207ENST00000572815 811 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 AC005746.2-201ENST00000585765 470 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 AC073592.10-201ENST00000624789 597 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 AL590094.1-206ENST00000635959 478 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 AL590094.1-209ENST00000637260 499 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 AC099795.2-201ENST00000639582 440 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 DHRS12-202ENST00000280056 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CC2D2AQ9P2K1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D2AQ9P2K1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D2AQ9P2K1 IQCF1-201ENST00000310914 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D2AQ9P2K1 AL356583.3-201ENST00000412354 417 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D2AQ9P2K1 RPL13AP5-201ENST00000439189 612 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D2AQ9P2K1 EEF1GP1-201ENST00000457231 1299 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D2AQ9P2K1 AL359915.1-201ENST00000457719 898 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D2AQ9P2K1 AP003062.1-201ENST00000528497 762 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D2AQ9P2K1 PXN-AS1-205ENST00000542314 707 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D2AQ9P2K1 AL109983.1-201ENST00000603234 646 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D2AQ9P2K1 AC092535.4-201ENST00000609548 397 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D2AQ9P2K1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D2AQ9P2K1 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D2AQ9P2K1 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D2AQ9P2K1 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CC2D2AQ9P2K1 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CC2D2AQ9P2K1 NPPB-201ENST00000376468 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CC2D2AQ9P2K1 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CC2D2AQ9P2K1 AC105446.1-201ENST00000441882 407 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CC2D2AQ9P2K1 RN7SL789P-201ENST00000478944 293 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CC2D2AQ9P2K1 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CC2D2AQ9P2K1 AC025259.1-201ENST00000550301 647 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms