Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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