Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms