Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms