Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD87

C6orf50, Putative uncharacterized protein C6orf50, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf50Q9HD87 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf50Q9HD87 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf50Q9HD87 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf50Q9HD87 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf50Q9HD87 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf50Q9HD87 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf50Q9HD87 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf50Q9HD87 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf50Q9HD87 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf50Q9HD87 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf50Q9HD87 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf50Q9HD87 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf50Q9HD87 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf50Q9HD87 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf50Q9HD87 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf50Q9HD87 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf50Q9HD87 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf50Q9HD87 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf50Q9HD87 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C6orf50Q9HD87 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C6orf50Q9HD87 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C6orf50Q9HD87 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C6orf50Q9HD87 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C6orf50Q9HD87 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C6orf50Q9HD87 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C6orf50Q9HD87 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C6orf50Q9HD87 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C6orf50Q9HD87 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C6orf50Q9HD87 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf50Q9HD87 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms