Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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