Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SEMA4CQ9C0C4 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms