Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNS3Q9BQ31 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
KCNS3Q9BQ31 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms