Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms